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本帖最后由 donglei 于 2017-4-7 10:13 编辑
' `7 W1 a& s j. O" ^
+ T( ~; L1 P4 V9 ~Clonal Evolutionary Analysis during HER2 Blockade in HER2-Positive Inflammatory Breast Cancer: A Phase II Open-Label Clinical Trial of Afatinib +/- Vinorelbine PLoS Med IF:13.585 4 G% w5 ]& e) f5 l* \' k' p
文章概述( r& I$ [9 [ q- x( c/ W: G
1.II期开放式临床试验:HER2阳性炎性乳腺癌患者,阿法替尼单药 vs. 阿法替尼+长春瑞滨,单药治疗前后组织样本前瞻性全外测序;8 N/ u; U9 d$ J* o
2.阿法替尼单药治疗临床获益率35%,阿法替尼+长春瑞滨临床获益率20%,所有患者均存在治疗相关不良反应;
8 X# W+ m3 G7 C8 W3.与非炎性乳腺癌相比,炎性乳腺癌基因突变率升高(TP53),新抗原增加;
# A9 T$ q. V; B% ]4.治疗前后组织样本基因组变异结构具有一定稳定性,单药治疗前后克隆进化存在两种模式: branched evolution,shifting clonal structure: ~; B; @* ]5 o9 G$ c: b9 _4 r
文章亮点
8 T/ y0 _* y/ b6 n& ]( e4 s1.着眼于乳腺癌中恶性程度较高、已知信息较少的炎性乳腺癌(IBC)进行研究,一定程度上分析了非炎性乳腺癌(NIBC)与IBC之间的差异;
' t, G3 |. o- T8 Y2 D+ q/ O2.EGFR、HER2双靶点抑制剂阿法替尼跨适应症应用探索;
I P' e$ w" g4 |. E( @3.临床试验+基因组分析,结合临床信息从分子水平解析IBC特征;; k& i' F; V0 x+ }
4.治疗前后节点取样,探究IBC阿法替尼单药治疗前后克隆进化过程
8 I2 v2 B% g6 j% K- G+ q# w5 O+ v1.研究背景, V$ t x3 `- P/ L5 u% M2 z
1.IBC是一种发病年龄小、高侵袭性、不良预后、高转移性的乳腺癌亚型,总体发病率约占乳腺癌的1~6%;6 R0 d! @2 u3 X; W
2.前期报道中,IBC突变频谱与NIBC相比有所不同,但整体景观仍未可知; {; j/ w, n. P9 _4 X: @& F q, A. x+ V
3.一些临床试验中,已有证据表明阿法替尼能使转移性乳腺癌患者获益(BIBW 2992,LUX-Breast 1)。" H* {" K4 p9 [; t5 S" W
2. 试验设计
4 x% t2 b4 u! J% E$ @研究流程
" `& s; c9 u1 m# Q# H/ N' O6 Y% j$ `
$ G6 f* E1 W7 K$ u$ |7 b/ t7 ~
1.26名患者接受阿法替尼单药治疗(Part A);疾病进展后,10名患者接受阿法替尼+长春瑞滨联合治疗(Part B)
$ w- [$ I4 ^/ \4 w$ ~2.22名患者拥有治疗前组织样本,13名患者拥有治疗前后匹配组织样本
7 l0 t+ n" Y; F. _7 I' ~% }6 W/ Q3. 试验结果分析! |$ R! ^/ [# L0 n F* E3 t
患者临床获益比较- j+ x! t ]$ U, q
- X5 H( E4 ^9 |7 z. h/ A1.单药治疗临床获益率35%,PFS中值110.5 days;26名患者中有7名接受过曲妥珠单抗治疗,在接受与未接受群体中阿法替尼临床获益率分别为0%(0/7)、47%(9/19),PFS中值分别为64 days、151 days8 C6 b* i7 |/ o
2.联合治疗临床获益率20%,PFS中值106.0 days;10名患者中有4名接受过曲妥珠单抗治疗,在接受与未接受群体中阿法替尼临床获益率分别为50%(2/4)、0%(0/6)
5 ]+ v2 }/ p7 e, M" g. v( _不良反应汇总
& y! Z- I- D& i! \
3 N8 c8 o+ r" r% o
1.无论是单药治疗还是联合治疗,不良反应率均达到100%+ a& Z) z% e2 `
2.3级以上不良反应率偏高(38%、70%)
! J$ f& K% c5 u1 {# R5 a: j& T3.单药治疗过程中,最常见不良反应及3级以上均为腹泻;联合治疗过程中,最常见不良反应为中性粒细胞减少及腹泻,最常见3级以上不良反应为中性粒细胞减少
- S1 O0 p [( t7 e& Q. c9 m4. HER2阳性IBC突变频谱分析7 W) k$ N: f9 r3 R
22名患者疗前样本突变频谱分析% \7 Z7 A0 q, f- m0 E1 Y
) s8 }! [; D# d4 a
1.平均突变数:134.5(30–468),最常见突变基因为TP53(86.4% ,19/22)% g0 x2 |% n% f, p
2.PI3K/AKT/mTOR通路相关基因突变率较高5 x+ {7 Z/ q6 G% l
3.ERBB2扩增率并非100%,可能由于肿瘤异质性或正常组织污染造成
, J2 V' ]6 v1 B Q5 w/ g0 c" |
- D+ o+ m) |/ l$ j! t1.GISTIC分析确定了HER2阳性IBC患者染色体上4个常见扩增区域,及12个常见缺失区域
5 T4 o) K; O: z) x' n- ~3 o* V2.与NIBC相比,IBC非同义突变率上升,新抗原增加,TP53突变率上升& c5 E" w5 f7 _- i: s. C. f# i
5. 治疗过程中的克隆进化分析
8 q/ o6 W6 ~* b& O$ @6 U6 U13对配对组织样本基因组分析
4 u* _* O: I3 w9 _$ Z7 P# Y1 B1 O
3 l4 l$ z$ O- `' z( D# D0 f; o# I1.疗后13组织样本平均突变数181.4 (50–505),其中79.1% ± 12.0%突变与疗前配对样本共有; e( X& J6 B, O/ {8 \
2.治疗前后拷贝数变化也具有很强的一致性;分级群聚结果显示,肿瘤组织样本通过患者来源而并非治疗状态聚合; O+ N; Y4 A1 U
两种克隆进化模式3 C0 k) ^3 K2 M" l( ^ a
% B8 u( \ J3 ^4 z6 y1 H
T1:疗前节点样本 T2:疗后节点样本 CCF:cancer cell fraction Clonal cluster::T1、T2 CCF均接近1.0的肿瘤细胞克隆群(图中数字1代表,其余均为Subclonal cluster)
. d$ i- R# Q' u7 e1.除主克隆外,亚克隆分别为两节点组织特有& U0 q$ }% {! B: e& a2 U0 E
2.主克隆、亚克隆均为两节点组织共有,仅CCF在治疗过程中有升高或降低# z4 f- P' P8 [8 [* ~) B
6. 讨论
3 Q( M) F6 R2 a$ c& ?1.阿法替尼单药或联合长春瑞滨均能使HER2阳性IBC患者获益9 z% X$ G/ N9 \. g0 @4 V
2.HER2阳性IBC具有更高的突变及新抗原负荷,与NIBC相比,TP53突变率偏高是其显著的突变频谱特征
. c5 ^7 \2 [5 [+ q. P7 @) {9 B* S3.该研究中,治疗前后配对组织基因组分析没有发现突出的耐药性克隆,表观遗传学及微环境可能是IBC耐药性研究的未来方向+ V9 D: d! N& b+ [/ N+ A U: ^
转自吉因加科技微信订阅号7 s% o) l( x- y% q* H
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